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诊所申报执行业务所得之时，可依财政部所颁定的费用率，直接迳行申报，亦可自行设帐，并依据诊所的帐载金额，申报『执行业务所得损益计算表』；前者的申报方式，较为方便，而后者，则较为符合诊所真实营运的成果。
然而，当诊所依据设帐金额，填具当年度执行业务所得损益计算表时，除应留意申报书上，申报金额栏、自行调整后金额栏的填具应注意事项外，自行调整后金额栏，最下方的【纯益率】与【本年度所得额】，亦有应留意的细节与适用要件。
其中，当诊所以设帐申报执行业务所得之时，自行调整后金额栏下的纯益率，有以下三种决定方式：
一、按书审纯益率核定
财政部每年会公布执行业务所得者，适用的书审纯益率，如：中西医20%、牙医25%，故诊所於申报之前，要留意需同时符合以下两个要件：
(一)依法入帐后的申报金额栏所得额，应该低於自行调整后金额栏；且
(二)自行填写调整后金额栏的纯益率，需达书审纯益率以上标准。
才能适用依据书审纯益率申报的方式。
二、按前三年平均纯益率核定
依据诊所前三年纯益率平均值，核定为诊所的纯益率，但计算前三年纯益率平均值时，须留意以下限制：
(一)前三年纯益率，若未达6%，不并入平均值计算之列。
(二)医疗院所收入超过1亿，事务所收入超过2亿，若前三年经核定的纯益率，与自行申报的纯益，其差异未达1%，即便平均纯益率低於6%，亦可适用。
(三)此法仅适用五年，第六年应改以通知查帐的方式申报，除非符合特定要件。
再者，诊所依此法申报前，亦要留意需同时符合以下两要件：
(一)依法入帐后的申报金额栏所得额，应低於自行调整后金额栏；且
(二)自行填写调整后金额栏的纯益率，需达前三年平均纯益率以上标准。
才能适用依据前三年平均纯益率核定申报的方式。
三、通知查帐
直接依设帐的帐载数，依法自行填写申报金额栏、自行调整后金额栏，迳行申报。
相关细节与说明，欢迎参与以下研讨：
【各类所得扣缴申报】...more
【私人诊所的税赋申报解析项】...more
【执行业务所得(组织)税务申报与二代健保】...more
参考资料：
翰鼎会计记帐士事务所
注：请尊重本人之智慧财产与著作权，请勿复制、转贴、抄袭於公开与非公开资讯、引述於非校园内之学术用途或以各形式为下载、出版之用，若经发现将寻求法律的必要保障。若需引用请详细载明出处与来源，谢谢您。
(二)医疗院所收入超过1亿，事务所收入超过2亿，若前三年经核定的纯益率，与自行申报的纯益，其差异未达1%，即便平均纯益率低於6%，亦可适用。
(三)此法仅适用五年，第六年应改以通知查帐的方式申报，除非符合特定要件。
再者，诊所依此法申报前，亦要留意需同时符合以下两要件：
(一)依法入帐后的申报金额栏所得额，应低於自行调整后金额栏；且
(二)自行填写调整后金额栏的纯益率，需达前三年平均纯益率以上标准。
才能适用依据前三年平均纯益率核定申报的方式。
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