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私人诊所的执业医师，包含：受雇医师、合伙(独资)医师；受雇医师与诊所之间，存在聘雇关系，故应该由诊所依据受雇医师的平均薪资，为其纳保就业保险、职业灾害保险、提缴劳退金，并投保全民健保。
然而，诊所实质拥有者：独资执业医师或联合执业医师，乃属诊所的营运负责人，可自愿加保职灾保险、自愿提缴劳退金；然而，全民健保，原则上，应以最高级距，於自己的诊所纳保，但实际状况，却相对比较复杂。可分就以下状况解析：
一、以执行业务所得於自己的诊所纳保全民健保
(一)但当年度执行业务所得未明
若诊所属当年度刚开业或刚复业，执行业务所得尚未结算，故在执行业务所得未明的情况下，可暂以每月45,800纳保，但不能低於自己或诊所员工其纳保劳退金提缴、劳工保险、职灾保险的投保薪资。亦即：
独资执业或联合执业医师之全民健保每月纳保级距=
Max(45,800, 自己与员工纳劳保、灾保、劳退金提缴之级距)
(二)当年度执行业务所得已明确
当诊所在每年5月，完成上年度执行业务所得的结算，并完成申报之后，应在5月底之前，依该执行业务所得的金额，调整全民健保的纳保级距，并回溯自当年度3月起生效适用。亦即，全民健保的纳保级距，需自我审视并调整为：
独资执业或联合执业医师之全民健保每月纳保级距=
Max(执行业务所得, 45,800, 自己与员工纳劳保、灾保、劳退金提缴之级距)
若独资执业或联合执业医师，未依据实际执行业务所得纳保，且未调整全民健保投保级距而有漏缴保费的话，则将产生相关罚则。
二、非以执行业务所得於自己诊所纳保全民健保
若独资执业或联合执业医师，是以正职员工身份，於其他单位纳保，而非以执行业务所得，於自己诊所投保全民健保的话：
在每年5月，诊所完成执行业务所得结算申报，并依据出资比例配发执行业务所得时，诊所负责人(扣费义务人)需先扣下执行业务所得(分配额)的二代健保补充保费，并於次月月底前完成缴纳，隔年一月底之前，完成明细申报。
若诊所应扣未扣二代健保补充保费的话，则将产生相关罚则。
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参考资料：
翰鼎会计记帐士事务所
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