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私人诊所，属於执行业务所得的组织，故一般来说，在申报税赋之前，需先充分掌握执行业务收入的全貌，扣除必要支出之后，再申报执行业务所得。
一、执行业务收入
其各项来源，包含：扣缴凭单与分列项目表所列示、自费收入、其他细项。
二、执行业务支出
其各项支出，如：薪资支出、材料费、租金及权利金支出、旅费、伙食费、邮电费...等，共计十多项。
都应依法帐载；再依帐载的执行业务收入总额，扣除执行业务费用总额，计算出最后的本年度帐载所得额；然而，私人诊所的依法设帐，与税赋申报方式，两者之间，并不冲突。
反倒是，应该先以帐载数为申报税赋的基础，并依相关法规，自行调整报税的金额；其中，需调整的费用，包含：
一、超过限额得依法剔除，如：交际费、职工福利、捐赠...等。
二、未取得符合税法规范之凭证。
而当私人诊所，年度帐载所得额，低於书审纯益率、三年平均纯益率，或财政部颁定费用标准之时，才得以后三者之一，申报纳税。
再者，依据『执行业务所得查核办法』第8条、第8之1条可知，私人诊所依财政部颁定的标准，直接核定申报，恐属例外状况；是故，如果私人诊所，将直接采用部颁费用率申报而不设帐，视为常态或理所当然的话，可能就本末倒置了。
换句话说，当私人诊所，依部颁费用率申报执行业务所得之后，是否即可弃绝税赋疑虑？可能仍应回溯真实设帐的帐载数，才能判断主管机关所查得的资料，是否与私人诊所的真实营运成果一致。
而前述的相关支出，若有需依法办理扣缴申报，如：薪资、租金、权利金、佣金、复委托费...等，诊所仍应尽到扣缴申报的责任。
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参考资料：www.unicore.url.tw
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