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私人診所的執業醫師，包含：受僱醫師、合夥(獨資)醫師；受僱醫師與診所之間，存在聘僱關係，故應該由診所依據受僱醫師的平均薪資，為其納保就業保險、職業災害保險、提繳勞退金，並投保全民健保。
然而，診所實質擁有者：獨資執業醫師或聯合執業醫師，乃屬診所的營運負責人，可自願加保職災保險、自願提繳勞退金；然而，全民健保，原則上，應以最高級距，於自己的診所納保，但實際狀況，卻相對比較複雜。可分就以下狀況解析：
一、以執行業務所得於自己的診所納保全民健保
(一)但當年度執行業務所得未明
若診所屬當年度剛開業或剛復業，執行業務所得尚未結算，故在執行業務所得未明的情況下，可暫以每月45,800納保，但不能低於自己或診所員工其納保勞退金提繳、勞工保險、職災保險的投保薪資。亦即：
獨資執業或聯合執業醫師之全民健保每月納保級距=
Max(45,800, 自己與員工納勞保、災保、勞退金提繳之級距)
(二)當年度執行業務所得已明確
當診所在每年5月，完成上年度執行業務所得的結算，並完成申報之後，應在5月底之前，依該執行業務所得的金額，調整全民健保的納保級距，並回溯自當年度3月起生效適用。亦即，全民健保的納保級距，需自我審視並調整為：
獨資執業或聯合執業醫師之全民健保每月納保級距=
Max(執行業務所得, 45,800, 自己與員工納勞保、災保、勞退金提繳之級距)
若獨資執業或聯合執業醫師，未依據實際執行業務所得納保，且未調整全民健保投保級距而有漏繳保費的話，則將產生相關罰則。
二、非以執行業務所得於自己診所納保全民健保
若獨資執業或聯合執業醫師，是以正職員工身份，於其他單位納保，而非以執行業務所得，於自己診所投保全民健保的話：
在每年5月，診所完成執行業務所得結算申報，並依據出資比例配發執行業務所得時，診所負責人(扣費義務人)需先扣下執行業務所得(分配額)的二代健保補充保費，並於次月月底前完成繳納，隔年一月底之前，完成明細申報。
若診所應扣未扣二代健保補充保費的話，則將產生相關罰則。
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參考資料：
翰鼎會計記帳士事務所
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