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當營利事業匯回所投資海外事業之盈餘時，若該盈餘已在當地納稅的話，所就源扣繳的稅賦，是可以抵扣台灣境內營所稅的，然而，依據所得稅法第3條第2項的規定：扣抵上限，不可超過加計海外盈餘之後，依台灣稅率計算所增加的稅額。
然而，就法規上的說明，或許較難以意會計算上的邏輯，我們用以下程序來做說明：
一、先驗證：境外已繳稅額=(A)
二、先計算：境內所得額*境內稅率=原本境內應納稅額 (B)
三、次計算：(境內所得額+境外所得額)*境內稅率=加計境外所得後的應納稅額 (C)
四、再計算：可扣抵境外已納稅負的上限(D)=Min(A, C-B)
五、最後算：當年度營利事業當年度國內實際應納稅額Tax=C-D
我們以下列的案例，進一步說明計算的方式：
假設一：境外扣繳稅率高
一、營利事業未加計海外子公司盈餘的課稅所得：5,000萬
二、境內營所稅率：20%
三、海外子公司盈餘2,000萬，匯回時，來源國扣繳稅率30%
四、海外子公司並非所得稅法第43之3條中，CFC的低稅賦國家
計算：
A.海外盈餘來源國扣繳稅款：2,000萬*30%=600萬
B.營利事業未加計海外盈餘前應納稅款：5,000萬*20%=1,000萬
C.營利事業加計海外盈餘後應納稅款：(5,000萬+2,000萬)*20%=1,400萬
C.-B.加計海外盈餘前後增加的應納稅款：1,400萬-1,000萬=400萬
D=Min(A, C-B).海外扣繳稅款抵扣上限：Min(600萬, 400萬)=400萬
Tax=C-D：營利事業實際應納稅額：1,400萬-400萬=1,000萬假設一：境外扣繳稅率高
一、營利事業未加計海外子公司盈餘的課稅所得：5,000萬
二、境內營所稅率：20%
三、海外子公司盈餘2,000萬，匯回時，來源國扣繳稅率30%
四、海外子公司並非所得稅法第43之3條中，CFC的低稅賦國家
計算：
A.海外盈餘來源國扣繳稅款：2,000萬*30%=600萬
B.營利事業未加計海外盈餘前應納稅款：5,000萬*20%=1,000萬
C.營利事業加計海外盈餘後應納稅款：(5,000萬+2,000萬)*20%=1,400萬
C.-B.加計海外盈餘前後增加的應納稅款：1,400萬-1,000萬=400萬
D=Min(A, C-B).海外扣繳稅款抵扣上限：Min(600萬, 400萬)=400萬
就稅賦綜效而言，營利事業理應繳稅1,400萬，但實際境內繳稅1,000萬、境外扣繳600萬，合計1,600萬，多了200萬重複課稅的損失。
假設二：境外扣繳稅率低
一、營利事業未加計海外子公司盈餘的課稅所得：5,000萬
二、境內營所稅率：20%
三、海外子公司盈餘2,000萬，匯回時，來源國扣繳稅率10%
四、海外子公司並非所得稅法第43之3條中，CFC的低稅賦國家
計算：
A.海外盈餘來源國扣繳稅款：2,000萬*10%=200萬
B.營利事業未加計海外盈餘前應納稅款：5,000萬*20%=1,000萬
C.營利事業加計海外盈餘後應納稅款：(5,000萬+2,000萬)*20%=1,400萬
C.-B.加計海外盈餘前後增加的應納稅款：1,400萬-1,000萬=400萬
D=Min(A, C-B).海外扣繳稅款抵扣上限：Min(200萬, 400萬)=200萬
Tax=C-D：營利事業實際應納稅額：1,400萬-200萬=1,200萬三、海外子公司盈餘2,000萬，匯回時，來源國扣繳稅率10%
四、海外子公司並非所得稅法第43之3條中，CFC的低稅賦國家
計算：
A.海外盈餘來源國扣繳稅款：2,000萬*10%=200萬
B.營利事業未加計海外盈餘前應納稅款：5,000萬*20%=1,000萬
C.營利事業加計海外盈餘後應納稅款：(5,000萬+2,000萬)*20%=1,400萬
C.-B.加計海外盈餘前後增加的應納稅款：1,400萬-1,000萬=400萬
D=Min(A, C-B).海外扣繳稅款抵扣上限：Min(200萬, 400萬)=200萬
就稅賦綜效而言，營利事業理應繳稅1,400萬，但實際境內繳稅1,200萬、境外扣繳200萬，合計1,400萬，並未有重複課稅的損失。
由此可知，當雙邊有租稅協議而適用低扣繳稅率的話，可避免台商產生重複課稅的損失。
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參考資料：
翰鼎會計記帳士事務所
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